Основной задачей социальной аптеки является реализация населению аптечного ассортимента лекарственных средств и изделий медицинского назначения, входящих в Перечень, а также реализация других лекарственных средств и изделий медицинского назначения, в том числе обеспечение лекарственными средствами отдельных категорий лиц на льготной основе.

Социальная аптека осуществляет ряд функций:

- закупает (кроме ввоза) лекарственные средства и изделия медицинского назначения у поставщиков, имеющих лицензию на производство лекарственных средств и изделий медицинского назначения, а также на оптовую реализацию лекарственных средств и изделий медицинского назначения;

- лекарственные средства реализуются в розницу по рецептам, утвержденным Министерством здравоохранения Республики Узбекистан, а также без рецепта, а также в порядке, установленном законодательством, обеспечиваются лекарственными средствами отдельные категории граждан, имеющие льготы;

- обеспечивает хранение, уничтожение лекарственных средств и изделий медицинского назначения в установленном порядке;

- извещает Министерство здравоохранения Республики Узбекистан о случаях побочного действия и отсутствия эффективности лекарственных средств, выявленных при поступлении жалоб от потребителей, обнаружении фальсифицированных, недоброкачественных лекарственных средств и изделий медицинского назначения, а также предотвращает их распространение;

- ежеквартально предоставляет в районные (городские) медицинские объединения информацию о наличии в социальной аптеке и временно отсутствующих лекарственных средствах, входящих в Перечень лекарственных средств, предназначенных для льготного обеспечения при амбулаторном лечении;

- предоставляет бесплатную консультативную и информационную помощь населению по применению и хранению лекарственных средств и изделий медицинского назначения;

- обеспечивает ведение учетно-отчетной документации по движению лекарственных средств и изделий медицинского назначения по всей сети социальных аптек в электронном виде, обеспечивающей возможность предоставления информации населению о наличии лекарственных средств и изделий медицинского назначения;

- размещает на видном месте для посетителей социальной аптеки Перечень аптечного ассортимента с указанием их фиксированных цен;

- изготавливаетт лекарственные средства по рецептам врачей и осуществляет внутриаптечный контроль их качества (при наличии соответствующей лицензии).